Sihtasutusel on 5 üksust - 4 tegevusüksust (Tallinna eesti keele maja, Narva eesti keele maja, arenduskeskus ja rakenduskeskus), mis aitavad täita sihtasutuse tegevusvaldkondadega seotud valdkondlike arengukavade eesmärke ning tugiüksus, mis tegeleb kogu sihtasutuse üldjuhtimisega.